Абсолютных противопоказаний к поверхностной ЭЭГ нет. Метод безопасен, никакие электрические токи в мозг не подаются. Однако есть относительные трудности, которые могут затруднить фиксацию электродов:
Фотостимуляция при диагностике фоточувствительной эпилепсии несет риск провокации приступа, поэтому ее проводят с особой осторожностью, в специальном помещении с приглушенным светом, на расстоянии от пациента и обязательно под наблюдением врача.
Наличие имплантированных устройств (кардиостимуляторов, нейростимуляторов) может потребовать определенных мер предосторожности при проведении ЭЭГ, а иногда и вовсе может быть противопоказанием, в зависимости от типа устройства и его совместимости с аппаратом для ЭЭГ.
Выраженные артефакты во время процедуры (движения, мышечное напряжение, плохой контакт электродов с кожей головы) снижают информативность исследования и требуют его повторного проведения.